RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 TNIP1Q15025 636 aa10.08□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.08□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 PTPN22Q9Y2R2 807 aa10.08□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 IL16Q14005 1332 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 GNAI1P63096 354 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 HLFQ16534 295 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 MCM10Q7L590 875 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 WDR63Q8IWG1 891 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 IL17REQ8NFR9 667 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF333Q96JL9 665 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM17Q9Y577 477 aa10.07□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 BDP1A6H8Y1 2624 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 FAM177BA6PVY3 158 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 MOB2Q70IA6 237 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 LRCH3Q96II8 777 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 IFT57Q9NWB7 429 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ERBB4Q15303 1308 aa10.06□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 RTL9Q8NET4 1388 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF26B4DH59 902 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 WWC1Q8IX03 1113 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 PRDM6Q9NQX0 595 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 GGA3Q9NZ52 723 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 USP16Q9Y5T5 823 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.05□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PPC1 479 aa10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 PSMD14O00487 310 aa10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 KCNQ3O43525 872 aa10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.04□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 PIEZO1Q92508 2521 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 E9PSI1 815 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 GOLGA2Q08379 1002 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 DCTN1Q14203 1278 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 SULF1Q8IWU6 871 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 ABCC4O15439 1325 aa10.03□□□□□ -0.8
ZNF548-208ENST00000597576 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 SREBF2Q12772 1141 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 GPR153Q6NV75 609 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 NYXQ9GZU5 481 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 COL4A1P02462 1669 aa10.02□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 CHL1O00533 1208 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 HOXB7P09629 217 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 SHISA4Q96DD7 197 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.01□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 NTSR2O95665 410 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 SP8Q8IXZ3 490 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 MPNDQ8N594 471 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ALDH1A1P00352 501 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 IFNL1Q8IU54 200 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ERO1AQ96HE7 468 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 OTOFQ9HC10 1997 aa9.99□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF853P0CG23 659 aa9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ZNF548-208ENST00000597576 SCARF1Q14162 830 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms