RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.26	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	PPIP5K2	O43314	1243 aa		28.25	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	GPSM2	P81274	684 aa		28.25	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		28.25	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.25	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	FZD9	O00144	591 aa		28.24	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		28.24	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	XDH	P47989	1333 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	WASHC4	Q2M389	1173 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	SLC51A	Q86UW1	340 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	NIM1K	Q8IY84	436 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	KAZALD1	Q96I82	304 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.23	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	PCNT	O95613	3336 aa		28.22	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.22	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		28.22	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.22	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	AOC3	Q16853	763 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	POLL	Q9UGP5	575 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	COL4A1	P02462	1669 aa		28.21	■■■□□ 2.11
APBA3-208	ENST00000592826	POTEC	B2RU33	542 aa		28.2	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	GNAI3	P08754	354 aa		28.2	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		28.2	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	MS4A1	P11836	297 aa		28.19	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		28.19	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	UFL1	O94874	794 aa		28.18	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.18	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.18	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		28.17	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	GPC2	Q8N158	579 aa		28.17	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.17	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	LTBP1	Q14766	1721 aa		28.16	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.16	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		28.16	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
APBA3-208	ENST00000592826	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	CHRND	Q07001	517 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	MEIS3	Q99687	375 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		28.13	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	TNIP1	Q15025	636 aa		28.12	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		28.12	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	COL4A5	P29400	1685 aa		28.11	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826		G3V3G9	751 aa		28.11	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	RIMBP2	O15034	1052 aa		28.11	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.11	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.11	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	TNN	Q9UQP3	1299 aa		28.1	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	28.1	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.1	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.1	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	SPEF2	Q9C093	1822 aa		28.09	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	KCNJ4	P48050	445 aa		28.09	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28.09	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.09	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	GNAI2	P04899	355 aa		28.08	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	CXCL9	Q07325	125 aa		28.08	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	FBXO3	Q9UK99	471 aa		28.08	■■■□□ 2.09
APBA3-208	ENST00000592826	SCN4A	P35499	1836 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	ECE2	O60344	883 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.07	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.06	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.06	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.05	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	YDJC	A8MPS7	323 aa		28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	MTX1	Q13505	466 aa		28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	TNS4	Q8IZW8	715 aa		28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.04	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	RLBP1	P12271	317 aa		28.03	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.03	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.03	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	TAF5L	O75529	589 aa		28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	RAD17	O75943	681 aa		28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08

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