RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 HINFPQ9BQA5 517 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 PPME1Q9Y570 386 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 PRR19A6NJB7 356 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 DGKZQ13574 1117 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 UCN2Q96RP3 112 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRM-204ENST00000577468 OPLAHO14841 1288 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 RAD21O60216 631 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 XYLBO75191 536 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 JAG1P78504 1218 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 HMX2A2RU54 273 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 MMP20O60882 483 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ACAD11Q709F0 780 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 MYO19Q96H55 970 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 MYRFLQ96LU7 910 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.667e-8■■■■■ 186.3
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 POM121CA8CG34 1229 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01387J3KSC0 135 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 FOXO3O43524 673 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 WISP1O95388 367 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 CDC27P30260 824 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 DPYDQ12882 1025 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 OGFOD2Q6N063 350 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP13Q86W25 1043 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ABI1Q8IZP0 508 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ASIC4Q96FT7 647 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 POM121Q96HA1 1249 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRM-204ENST00000577468 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 TM4SF5O14894 197 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRM-204ENST00000577468 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 BMP3P12645 472 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 WEE1P30291 646 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 PTK7Q13308 1070 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD34AQ69YU3 496 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 BEND4Q6ZU67 534 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 TREML1Q86YW5 311 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 SPACA7Q96KW9 195 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 PIM2Q9P1W9 311 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRM-204ENST00000577468 WDR64B1ANS9 1081 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 FSCN2O14926 492 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 C8AP07357 584 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 HYAL2Q12891 473 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 OR13H1Q8NG92 308 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL18Q96ME1 805 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 FAM177BA6PVY3 158 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 LGR5O75473 907 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 CEP135Q66GS9 1140 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 CBLL1Q75N03 491 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 ATG3Q9NT62 314 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-204ENST00000577468 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.64□□□□□ -1.67
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