RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568900.5

SPNS1-212, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2

Gene SPNS1, Length 2,253 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-212ENST00000568900 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 SETDB2Q96T68 719 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 HSPA4P34932 840 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 ANAPC15P60006 121 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 NBR1Q14596 966 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 GOLIM4O00461 696 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 RFC4P35249 363 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 RTL9Q8NET4 1388 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 CASZ1Q86V15 1759 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 PDE8BO95263 885 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 PTH1RQ03431 593 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.2■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 ST18O60284 1047 aa25.2■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 NYXQ9GZU5 481 aa25.2■■□□□ 1.63
SPNS1-212ENST00000568900 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 ABCC12Q96J65 1359 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 CHGBP05060 677 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 SNRKQ9NRH2 765 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 MED23Q9ULK4 1368 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 NEK4P51957 841 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 IL17RAQ96F46 866 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 COL4A1P02462 1669 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 TAF1P21675 1872 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 ADRA2BP18089 450 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 SCARF1Q14162 830 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 TAF5LO75529 589 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 RASEFQ8IZ41 740 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 LPIN2Q92539 896 aa25.15■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 FGFR2P21802 821 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.14■■□□□ 1.62
SPNS1-212ENST00000568900 RXRBP28702 533 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 KCNJ4P48050 445 aa25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 TXNRD1Q16881 649 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 MAP4K1Q92918 833 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 SNAP23O00161 211 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 NPHP1O15259 732 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 SLC5A1P13866 664 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 ZAP70P43403 619 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 PI16Q6UXB8 463 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 PROM2Q8N271 834 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 NLRP3Q96P20 1036 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 MCAMP43121 646 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 PHKA1P46020 1223 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CHRNDQ07001 517 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 NFIXQ14938 502 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 NECTIN1Q15223 517 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CCDC102BQ68D86 513 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.11■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 TICAM2Q86XR7 235 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 SSFA2P28290 1259 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 NFKBIBQ15653 356 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 KCNB2Q92953 911 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.08■■□□□ 1.61
SPNS1-212ENST00000568900 APBA3O96018 575 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-212ENST00000568900 DDIT3P35638 169 aa25.07■■□□□ 1.6
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