RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 TM4SF1P30408 202 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU2-208ENST00000566637 ATP5JP18859 108 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 ST5P78524 1137 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 STK32BQ9NY57 414 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 SERPINB2P05120 415 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 TIMM10P62072 90 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 ATP2B3Q16720 1220 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 EVI5LQ96CN4 794 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.06■■□□□ 1.6
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CTU2-208ENST00000566637 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.05■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.05■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 PDE8BO95263 885 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 CHMLP26374 656 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.03■■□□□ 1.6
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CTU2-208ENST00000566637 DDR1Q08345 913 aa25.03■■□□□ 1.6
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CTU2-208ENST00000566637 SLC15A2Q16348 729 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 XAGE2Q96GT9 111 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-208ENST00000566637 REC8O95072 547 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 HAUS7Q99871 368 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 SLC5A1P13866 664 aa25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 ADORA1P30542 326 aa25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 LPIN2Q92539 896 aa25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 COL4A1P02462 1669 aa24.99■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 HIP1O00291 1037 aa24.99■■□□□ 1.59
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CTU2-208ENST00000566637 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.99■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 FSD1Q9BTV5 496 aa24.99■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 CHRNDQ07001 517 aa24.98■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.98■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 TAF1P21675 1872 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 FGFR2P21802 821 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 CCDC125Q86Z20 511 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.97■■□□□ 1.59
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CTU2-208ENST00000566637 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.97■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 TAF5LO75529 589 aa24.96■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.96■■□□□ 1.59
CTU2-208ENST00000566637 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 MMP10P09238 476 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 GRAPQ13588 217 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 CRY2Q49AN0 593 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 MSL1Q68DK7 614 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.94■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.93■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 GOLIM4O00461 696 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 USP26Q9BXU7 913 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.92■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 SGSM2O43147 1006 aa24.91■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 UBE4AQ14139 1066 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 CCDC102BQ68D86 513 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 TICAM2Q86XR7 235 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 RAD50Q92878 1312 aa24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.89■■□□□ 1.58
CTU2-208ENST00000566637 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 KCNJ4P48050 445 aa24.89■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.89■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 MCCP23508 829 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 PHKA1P46020 1223 aa24.88■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTU2-208ENST00000566637 SNRKQ9NRH2 765 aa24.88■■□□□ 1.57
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