RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF14	Q5TI25	921 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF15	Q8N660	670 aa		21.76	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559		H3BQV1	296 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	IFFO2	Q5TF58	517 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	TNMD	Q9H2S6	317 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP45	Q9UL16	551 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		21.75	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	LIG1	P18858	919 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	PFKFB2	O60825	505 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CIAO1	O76071	339 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		21.74	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	EYA2	O00167	538 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	GOLIM4	O00461	696 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	TYRO3	Q06418	890 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	BRF1	Q92994	677 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	DACT1	Q9NYF0	836 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	JAK2	O60674	1132 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	UQCRH	P07919	91 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	REST	Q13127	1097 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	21.73	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC1I1	O14576	645 aa		21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	PLCB2	Q00722	1185 aa		21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	SPEF2	Q9C093	1822 aa		21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		21.72	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	CAVIN2	O95810	425 aa		21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	MAP7D2	Q96T17	732 aa		21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		21.71	■■□□□ 1.07
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM10	P62072	90 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	SCRN1	Q12765	414 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO3	Q9UK99	471 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK4	Q16566	473 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ATL3	Q6DD88	541 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		21.7	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	BICD2	Q8TD16	824 aa		21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	TJP1	Q07157	1748 aa		21.69	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CHGB	P05060	677 aa		21.68	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		21.68	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	21.68	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		21.68	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		21.68	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUL7	405 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	A1BG	P04217	495 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	DDX11	Q96FC9	970 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	PGBD1	Q96JS3	809 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		21.67	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	LAMA4	Q16363	1823 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559		E7EWF7	191 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	AP5Z1	O43299	807 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL16	Q8N461	479 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	MPND	Q8N594	471 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	PAPPA	Q13219	1627 aa		21.66	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	NR1I2	O75469	434 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC24	Q50LG9	513 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		21.65	■■□□□ 1.06

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