RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 GNRH1P01148 92 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 POU4F2Q12837 409 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 TXNRD1Q16881 649 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 RNF135Q8IUD6 432 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 STK26Q9P289 416 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 SBNO1A3KN83 1393 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 WASHC4Q2M389 1173 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA0232Q92628 1395 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 CNKSR1Q969H4 720 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 KIF1BO60333 1816 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.96□□□□□ -1.29
TMOD3-210ENST00000561408 AKAP12Q02952 1782 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TOMM70O94826 608 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 IL2RAP01589 272 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 EVA1CP58658 441 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 CENPCQ03188 943 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 USP4Q13107 963 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SEMA3FQ13275 785 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 NBPF15Q8N660 670 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 CLTCL1P53675 1640 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SSH2Q76I76 1423 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC37A3O60309 1634 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF827Q17R98 1081 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 COG6Q9Y2V7 657 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.95□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PAPPAQ13219 1627 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 POLD1P28340 1107 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SIRT1Q96EB6 747 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 XAGE2Q96GT9 111 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SOX11P35716 441 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 DBN1Q16643 649 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 WDR44Q5JSH3 913 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GMCL1Q96IK5 515 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ATP7BP35670 1465 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 H7C1W4 665 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GPR25O00155 361 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PHKA2P46019 1235 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 GAS6Q14393 721 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SVOPQ8N4V2 548 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 PPLO60437 1756 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 SLURP2P0DP57 97 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 WHAMMQ8TF30 809 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 POM121Q96HA1 1249 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 BTAF1O14981 1849 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-210ENST00000561408 F11P03951 625 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms