RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF2CQ99661 725 aa21.65■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.64■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP3Q96P20 1036 aa21.64■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.64■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 IL25Q9H293 177 aa21.64■■□□□ 1.06
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.63■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.63■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDE8BO95263 885 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNBD1Q8NA66 436 aa21.62■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CASZ1Q86V15 1759 aa21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 FSD1Q9BTV5 496 aa21.61■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SGSM2O43147 1006 aa21.6■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADORA1P30542 326 aa21.6■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP2B3Q16720 1220 aa21.6■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPHP1O15259 732 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 SERPINB2P05120 415 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 XAGE2Q96GT9 111 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 HAUS7Q99871 368 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL4A1P02462 1669 aa21.59■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDR1Q08345 913 aa21.58■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 GORABQ5T7V8 394 aa21.58■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.58■■□□□ 1.05
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 FGFR2P21802 821 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.57■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 BAG6P46379 1132 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 ST5P78524 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 LPIN2Q92539 896 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM227BQ96M60 508 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPEF2Q9C093 1822 aa21.56■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIP1O00291 1037 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC15A2Q16348 729 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSCBQ8IWL3 235 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 MCCP23508 829 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNDQ07001 517 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.55■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLIM4O00461 696 aa21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNX21Q969T3 373 aa21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 RABEP1Q15276 862 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 STK32BQ9NY57 414 aa21.53■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A0D9SFI3 127 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF5LO75529 589 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC5A1P13866 664 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRY2Q49AN0 593 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 PALD1Q9ULE6 856 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TICAM2Q86XR7 235 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNRKQ9NRH2 765 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.52■■□□□ 1.04
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF1P21675 1872 aa21.52■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAD50Q92878 1312 aa21.51■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SNAP23O00161 211 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHGBP05060 677 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTH1RQ03431 593 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRAPQ13588 217 aa21.5■■□□□ 1.03
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCARF1Q14162 830 aa21.5■■□□□ 1.03
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