RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	NPR1	P16066	1061 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	NUP98	P52948	1817 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	TOMM70	O94826	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	HSPA6	P17066	643 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME2-208	ENST00000559359	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	OSBP	P22059	807 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	NTSR2	O95665	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	WNT2B	Q93097	391 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PSME2-208	ENST00000559359	POTEC	B2RU33	542 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	GNAI1	P63096	354 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HOXB7	P09629	217 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HTRA3	P83110	453 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	ANP32C	O43423	234 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	APLP1	P51693	650 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	FSTL1	Q12841	308 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	PTPN5	P54829	565 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PSME2-208	ENST00000559359	PRSS12	P56730	875 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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