RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 SPEM2Q0P670 501 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 LDLRAD1Q5T700 205 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 SYT9Q86SS6 491 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 SNX29Q8TEQ0 813 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 EFCC1Q9HA90 598 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 RRAGCQ9HB90 399 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 TNFRSF21O75509 655 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 EPB42P16452 691 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ALAS2P22557 587 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 GNA15P30679 374 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 DGKGP49619 791 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 PSMD2Q13200 908 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 USPL1Q5W0Q7 1092 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 CHSY3Q70JA7 882 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 TTC16Q8NEE8 873 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 ELOA3Q8NG57 546 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 TNFRSF25Q93038 417 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 SLC30A3Q99726 388 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 MDFIQ99750 246 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 BACH2Q9BYV9 841 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 DNAJC25Q9H1X3 360 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 MRS2Q9HD23 443 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-205ENST00000558714 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GNB5O14775 395 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 SORBS3O60504 671 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 IGSF3O75054 1194 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 IGHA1P01876 353 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 NEFLP07196 543 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GRIN2CQ14957 1233 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 XKR5Q6UX68 686 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 DCAF5Q96JK2 942 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PHACTR2O75167 634 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 XYLBO75191 536 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 EGFRP00533 1210 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ITGAEP38570 1179 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PI16Q6UXB8 463 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CHRDQ9H2X0 955 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ELP3Q9H9T3 547 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CRELD1Q96HD1 420 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 NPHS2Q9NP85 383 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CTSHP09668 335 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 FANCCQ00597 558 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CCINQ13939 588 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CCDC74AQ96AQ1 378 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 C8orf37Q96NL8 207 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GSX2Q9BZM3 304 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PRDM6Q9NQX0 595 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 SPG7Q9UQ90 795 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 AK5Q9Y6K8 562 aa4.87□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 EREGO14944 169 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 COL8A1P27658 744 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ADH7P40394 386 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 NLRP13Q86W25 1043 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GALNT12Q8IXK2 581 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 TMEM87AQ8NBN3 555 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 BHMTQ93088 406 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 FRMD6Q96NE9 622 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PNMA5Q96PV4 448 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 SUV39H2Q9H5I1 410 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 C12orf49Q9H741 205 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 CNTN3Q9P232 1028 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 MAP3K6O95382 1288 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 PCSK7Q16549 785 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.85□□□□□ -1.63
TMOD3-205ENST00000558714 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms