RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 TMC7Q7Z402 723 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 STK17AQ9UEE5 414 aa9.51□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 NESP48681 1621 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 CPB1P15086 417 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PDE3BQ13370 1112 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM35AQ86V20 835 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.5□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 J3QW42 95 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF4AO95239 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PCSK7Q16549 785 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PERM1Q5SV97 790 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 KANK3Q6NY19 840 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.49□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 EREGO14944 169 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 PHACTR2O75167 634 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 SIK1P57059 783 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 TMC1Q8TDI8 760 aa9.48□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 M0R082 166 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 CES1P23141 567 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 HYAL2Q12891 473 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ORC1Q13415 861 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 NUDT8Q8WV74 236 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 RRAGCQ9HB90 399 aa9.47□□□□□ -0.89
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ASB16Q96NS5 453 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.46□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ACPPP15309 386 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 DSC3Q14574 896 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TREHO43280 583 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ATP11AP98196 1134 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 GRIK5Q16478 980 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CEP120Q8N960 986 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PLD4Q96BZ4 506 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.44□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 GHRHP01286 108 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PMEPA1Q969W9 287 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.43□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NID1P14543 1247 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM11Q96F44 468 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.42□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SMARCA2P51531 1590 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 LILRB5O75023 590 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TTC9Q92623 222 aa9.41□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 NEFLP07196 543 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC27Q2M243 656 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 PODNQ7Z5L7 613 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SPACA7Q96KW9 195 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 CSRNP1Q96S65 589 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 RBSNQ9H1K0 784 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.4□□□□□ -0.9
AC009396.1-201ENST00000553628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 NFKBIEO00221 500 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 GNB5O14775 395 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 TRPA1O75762 1119 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 EDN3P14138 238 aa9.39□□□□□ -0.91
AC009396.1-201ENST00000553628 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 450.9 ms