RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 DYRK3O43781 588 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 COBLO75128 1261 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 CPB1P15086 417 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 TCF3P15923 654 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 MBTPS1Q14703 1052 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 MYH16Q9H6N6 1097 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFATQ9P243 1243 aa4.92□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 RARAP10276 462 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 RFX1P22670 979 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 GPLD1P80108 840 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 MSL1Q68DK7 614 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 ILDR2Q71H61 639 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 IFT43Q96FT9 208 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SYF2P1-201ENST00000550658 OPLAHO14841 1288 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 SASH3O75995 380 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 CDCA8Q53HL2 280 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PERM1Q5SV97 790 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 LCE1DQ5T752 114 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 BCL11AQ9H165 835 aa4.9□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 MARCH6O60337 910 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 EGFRP00533 1210 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PTMSP20962 102 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIK5Q16478 980 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 SWI5Q1ZZU3 235 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 GORABQ5T7V8 394 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 USP21Q9UK80 565 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 USP20Q9Y2K6 914 aa4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 XYLBO75191 536 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 NRLP54845 237 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PLAURQ03405 335 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 COX20Q5RI15 118 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TREML1Q86YW5 311 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC9Q92623 222 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PRIMPOLQ96LW4 560 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa4.88□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PRMT3O60678 531 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 OCLNQ16625 522 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO11Q86XK2 927 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TP53INP1Q96A56 240 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.87□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 PSAPP07602 524 aa4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SYF2P1-201ENST00000550658 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms