RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	HAUS7	Q99871	368 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PTPRR-208	ENST00000549107	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	COL4A1	P02462	1669 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	SGSM2	O43147	1006 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ADORA1	P30542	326 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	NFIX	Q14938	502 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	KIF2C	Q99661	725 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	HIP1	O00291	1037 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	BECN1	Q14457	450 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	IL25	Q9H293	177 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	EP400	Q96L91	3159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	PDE8B	O95263	885 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	GYS1	P13807	737 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	FGFR2	P21802	821 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	MCC	P23508	829 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	RAD50	Q92878	1312 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TAF1	P21675	1872 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	GOLIM4	O00461	696 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	NPHP1	O15259	732 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC5A1	P13866	664 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	RABEP1	Q15276	862 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	LPIN2	Q92539	896 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A0D9SFI3	127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	TAF5L	O75529	589 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	TM4SF1	P30408	202 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CHRND	Q07001	517 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	SNX21	Q969T3	373 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	SERPINB2	P05120	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	SCARF1	Q14162	830 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	HSPA4	P34932	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ANAPC15	P60006	121 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ST5	P78524	1137 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	DDR1	Q08345	913 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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