RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 BRD1O95696 1058 aa22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 EYA1Q99502 592 aa22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 CHD1O14646 1710 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 NCOA7Q8NI08 942 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 JADE2Q9NQC1 790 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 TRPM2O94759 1503 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 SPTLC2O15270 562 aa22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC175P0C221 793 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 CEP112Q8N8E3 955 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 SNRKQ9NRH2 765 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 ABCF2Q9UG63 623 aa22.21■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 C10orf67Q8IYJ2 551 aa22.2■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.2■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.2■■□□□ 1.15
SUDS3-204ENST00000543473 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SLC39A6Q13433 755 aa22.2■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.2■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF75DP51815 510 aa22.2■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CBX8Q9HC52 389 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 VPS18Q9P253 973 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZFYVE9O95405 1425 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 GPTP24298 496 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 KDM6BO15054 1643 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PKP1Q13835 747 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ELF2Q15723 593 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 LTKP29376 864 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 EVCP57679 992 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ALG1Q9BT22 464 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 RASSF4Q9H2L5 321 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PHACTR2O75167 634 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ORAI2Q96SN7 254 aa22.18■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CTAGE9A4FU28 777 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SPECC1Q5M775 1068 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 HOXC9P31274 260 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZPR1O75312 459 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 MAP3K12Q12852 859 aa22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.142e-6■■□□□ 12.1
SUDS3-204ENST00000543473 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 GPT2Q8TD30 523 aa22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB9Q96C00 473 aa22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.16■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TOM1O60784 492 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ALDH1L1O75891 902 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 TUBB4BP68371 445 aa22.15■■□□□ 1.14
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