RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 HIP1O00291 1037 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO3Q9UK99 471 aa24.45■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RFC4P35249 363 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR108Q9NPR9 543 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 PLSCR1O15162 318 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 NUCB2P80303 420 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 SPEF2Q9C093 1822 aa24.44■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 COL4A1P02462 1669 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF1P21675 1872 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 APBA3O96018 575 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 TIMM10P62072 90 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 LRP5O75197 1615 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF609O15014 1411 aa24.43■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 SETDB2Q96T68 719 aa24.42■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAK2O60296 914 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 ADRA2BP18089 450 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 PTMSP20962 102 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 TMX3Q96JJ7 454 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC12Q96J65 1359 aa24.41■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 SSFA2P28290 1259 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.4■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.39■■□□□ 1.5
PACSIN3-211ENST00000539589 RTL9Q8NET4 1388 aa24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GUL7 405 aa24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.39■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP5JP18859 108 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.38■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF827Q17R98 1081 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NFIXQ14938 502 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 FSD1Q9BTV5 496 aa24.37■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 GYS1P13807 737 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CUL4AQ13619 759 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NYXQ9GZU5 481 aa24.36■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL24Q5JXM2 366 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 ADORA1P30542 326 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.35■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 AKT1S1Q96B36 256 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRKQ9NRH2 765 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 PTH1RQ03431 593 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 RASEFQ8IZ41 740 aa24.34■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 XAGE2Q96GT9 111 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM227BQ96M60 508 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.33■■□□□ 1.49
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1B0GUL6 1792 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 BAG4O95429 457 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE8BO95263 885 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNB2Q92953 911 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 HAUS7Q99871 368 aa24.31■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP2B3Q16720 1220 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 TM4SF1P30408 202 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 MAP4K1Q92918 833 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.3■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0D9SFI3 127 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 NECTIN1Q15223 517 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC14Q96N46 770 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.29■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ4P48050 445 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 PKP1Q13835 747 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.28■■□□□ 1.48
PACSIN3-211ENST00000539589 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms