RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIMBP2O15034 1052 aa30.23■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.23■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 XDHP47989 1333 aa30.22■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 UFL1O94874 794 aa30.22■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.22■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 G3V3G9 751 aa30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ECE2O60344 883 aa30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DPF2Q92785 391 aa30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GREM2Q9H772 168 aa30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP2B4P23634 1241 aa30.19■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYH3P11055 1940 aa30.19■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 H7C1D1 291 aa30.18■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 E9PSI1 815 aa30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CASP7P55210 303 aa30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CNTNAP1P78357 1384 aa30.16■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSMD14O00487 310 aa30.16■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DOK7Q18PE1 504 aa30.16■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BEND3Q5T5X7 828 aa30.15■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 F6X3S4 739 aa30.14■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCER2I3L3R5 266 aa30.14■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CSF1RP07333 972 aa30.14■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.14■■■□□ 2.42
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ITGA6P23229 1130 aa30.13■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MICALL2Q8IY33 904 aa30.13■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.13■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.11■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MED23Q9ULK4 1368 aa30.11■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ALDH1L1O75891 902 aa30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM161AQ3B820 660 aa30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PODNQ7Z5L7 613 aa30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.1■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.09■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF609O15014 1411 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RASSF10A6NK89 507 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRM8O00222 908 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRPM4Q8TD43 1214 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.07■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLFN5Q08AF3 891 aa30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DEFB115Q30KQ5 88 aa30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.06■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PTPRCP08575 1304 aa30.05■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FOXO4P98177 505 aa30.04■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SHTN1A0MZ66 631 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP17L3A6NCW0 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP17L4A6NCW7 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRAF5O00463 557 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VEGFBP49765 207 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 COA1Q9GZY4 146 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.03■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SPEF2Q9C093 1822 aa30.02■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.01■■■□□ 2.4
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNJ4P48050 445 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC57Q2TAC2 916 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IFFO2Q5TF58 517 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CST9Q5W186 159 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LMBR1LQ6UX01 489 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCN9AQ15858 1988 aa30■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PCNTO95613 3336 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ECE1P42892 770 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHRNDQ07001 517 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.99■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.97■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PSME4Q14997 1843 aa29.97■■■□□ 2.39
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms