RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NEK11Q8NG66 645 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM66O15016 1216 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 MSL1Q68DK7 614 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 APBB1O00213 710 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 G3V3G9 751 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 DTNBO60941 627 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PRR29P0C7W0 189 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PEAK1Q9H792 1746 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 VAMP4O75379 141 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ST5P78524 1137 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.91□□□□□ -0.5
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TRPS1-211ENST00000520276 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 DISP2A7MBM2 1401 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 SLC15A2Q16348 729 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 USP27XA6NNY8 438 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PALD1Q9ULE6 856 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 ADRA2BP18089 450 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 CUL4AQ13619 759 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 SYT10Q6XYQ8 523 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 BCL9O00512 1426 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.9□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 TPM3P06753 285 aa11.9□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CEP135Q66GS9 1140 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 LUZP1Q86V48 1076 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 RGPD5Q99666 1765 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 FIBPO43427 364 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB7AO95365 584 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 PSEN1P49768 467 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 KSR2Q6VAB6 950 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 NYXQ9GZU5 481 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ILDR2Q71H61 639 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 EFCC1Q9HA90 598 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ITPK1Q13572 414 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 F6X3S4 739 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF853P0CG23 659 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 DRC7Q8IY82 874 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 GNAI3P08754 354 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 RASSF4Q9H2L5 321 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 SPON1Q9HCB6 807 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 HMMRO75330 724 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRCP08575 1304 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 CNBD1Q8NA66 436 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 REC8O95072 547 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 PARP10Q53GL7 1025 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.512e-8■□□□□ 10.5
TRPS1-211ENST00000520276 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 YY1AP1Q9H869 796 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 MMP14P50281 582 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2HP62256 183 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 ARID5BQ14865 1188 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-211ENST00000520276 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.86□□□□□ -0.51
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