RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 BCO2Q9BYV7 579 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 PWP1Q13610 501 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 APPBP2Q92624 585 aa6.96□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.96□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 KDM5BQ9UGL1 1544 aa6.95□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 PEX14O75381 377 aa6.95□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.95□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.95□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 STAC3Q96MF2 364 aa6.94□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 HOMER1Q86YM7 354 aa6.93□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 CLN3Q13286 438 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 GRM2Q14416 872 aa6.92□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 JDP2Q8WYK2 163 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 19.7
SEC24D-211ENST00000511481 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.92□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.91□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 PHACTR2O75167 634 aa6.91□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.91□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 EMP3P54852 163 aa6.91□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.91□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.91□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.91□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 RHOVQ96L33 236 aa6.91□□□□□ -1.3
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SEC24D-211ENST00000511481 MAP3K1Q13233 1512 aa6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 MASP1P48740 699 aa6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 CENPCQ03188 943 aa6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 MPNDQ8N594 471 aa6.9□□□□□ -1.3
SEC24D-211ENST00000511481 POTEB3A0JP26 581 aa6.9□□□□□ -1.31
SEC24D-211ENST00000511481 PLIN1O60240 522 aa6.9□□□□□ -1.31
SEC24D-211ENST00000511481 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
SEC24D-211ENST00000511481 TXLNAP40222 546 aa6.9□□□□□ -1.31
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