RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3V3G9 751 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UFL1O94874 794 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCKRQ14397 625 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GGA1Q9UJY5 639 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH3P11055 1940 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINS1Q8NG48 757 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ECE2O60344 883 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GREM2Q9H772 168 aa29.74■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMD14O00487 310 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XDHP47989 1333 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H7C1D1 291 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 F6X3S4 739 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.7■■■□□ 2.35
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTNAP1P78357 1384 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP2B4P23634 1241 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTL9Q8NET4 1388 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MICALL2Q8IY33 904 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPF2Q92785 391 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPEF2Q9C093 1822 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF521Q96K83 1311 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHTN1A0MZ66 631 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CASP7P55210 303 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF5O00463 557 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGA6P23229 1130 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS12P25398 132 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BEND3Q5T5X7 828 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCNTO95613 3336 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CSF1RP07333 972 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VEGFBP49765 207 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM161AQ3B820 660 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFFO2Q5TF58 517 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCN9AQ15858 1988 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 E9PSI1 815 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CST9Q5W186 159 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PODNQ7Z5L7 613 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MED23Q9ULK4 1368 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRM8O00222 908 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXO4P98177 505 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALDH1L1O75891 902 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L3A6NCW0 530 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L4A6NCW7 530 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EGFRP00533 1210 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLFN5Q08AF3 891 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP48Q86UV5 1035 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNJ4P48050 445 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCER2I3L3R5 266 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRNDQ07001 517 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRM1Q13255 1194 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COA1Q9GZY4 146 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLL2Q9Y6L7 1015 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSME4Q14997 1843 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.51■■■□□ 2.31
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