RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TICAM2Q86XR7 235 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUL7 405 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 SSFA2P28290 1259 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM10P62072 90 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TTC14Q96N46 770 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 LRP5O75197 1615 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP11Q9UKA4 1901 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CTSWP56202 376 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ITPK1Q13572 414 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 SYNE4Q8N205 404 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ARAP2Q8WZ64 1704 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CASZ1Q86V15 1759 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PDE8AO60658 829 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TAF7LQ5H9L4 462 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 AK7Q96M32 723 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 LAMA4Q16363 1823 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 TAF5LO75529 589 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CASTP20810 708 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PTMSP20962 102 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA6P23229 1130 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 GREM2Q9H772 168 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PAG1Q9NWQ8 432 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 CAMTA2O94983 1202 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 AK2P54819 239 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 PKP1Q13835 747 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00116Q8NCU8 138 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC12Q96J65 1359 aa9.84□□□□□ -0.83
PDE4D-208ENST00000502484 SCN7AQ01118 1682 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 SLC27A2O14975 620 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 TRAK2O60296 914 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 KCNJ4P48050 445 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 VPS53Q5VIR6 699 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 RNF20Q5VTR2 975 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 C4BP0C0L5 1744 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 GOLIM4O00461 696 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 PARP10Q53GL7 1025 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 RUFY3Q7L099 469 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 XAGE2Q96GT9 111 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 SUSD4Q5VX71 490 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 PSMA5P28066 241 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 METTL24Q5JXM2 366 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 STK32BQ9NY57 414 aa9.82□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 GNPATO15228 680 aa9.81□□□□□ -0.84
PDE4D-208ENST00000502484 CHGBP05060 677 aa9.81□□□□□ -0.84
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