RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
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HOXB3-212ENST00000498678 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 ATP2B3Q16720 1220 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 PDE8BO95263 885 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 C3orf67Q6ZVT6 689 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 UBR3Q6ZT12 1888 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 ABCC12Q96J65 1359 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 RABEP1Q15276 862 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.53■■■□□ 2.64
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HOXB3-212ENST00000498678 CCDC158Q5M9N0 1113 aa31.51■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 GORABQ5T7V8 394 aa31.51■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.51■■■□□ 2.64
HOXB3-212ENST00000498678 PLSCR1O15162 318 aa31.51■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 HSCBQ8IWL3 235 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXB3-212ENST00000498678 MCCP23508 829 aa31.5■■■□□ 2.63
HOXB3-212ENST00000498678 SSFA2P28290 1259 aa31.5■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 RAD50Q92878 1312 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa31.49■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 RFX7Q2KHR2 1363 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-212ENST00000498678 APBA3O96018 575 aa31.49■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 TTC39AQ5SRH9 613 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXB3-212ENST00000498678 POTEAQ6S8J7 498 aa31.49■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 A0A0D9SFI3 127 aa31.47■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 PALD1Q9ULE6 856 aa31.47■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 IL17RAQ96F46 866 aa31.46■■■□□ 2.63
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HOXB3-212ENST00000498678 SCARF1Q14162 830 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXB3-212ENST00000498678 TICAM2Q86XR7 235 aa31.43■■■□□ 2.62
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HOXB3-212ENST00000498678 MED23Q9ULK4 1368 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB3-212ENST00000498678 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB3-212ENST00000498678 CHGBP05060 677 aa31.41■■■□□ 2.62
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC5A1P13866 664 aa31.39■■■□□ 2.62
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HOXB3-212ENST00000498678 NPHP1O15259 732 aa31.38■■■□□ 2.61
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HOXB3-212ENST00000498678 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 SNX14Q9Y5W7 946 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 ST18O60284 1047 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 RPS8P62241 208 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 NECTIN1Q15223 517 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXB3-212ENST00000498678 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.34■■■□□ 2.61
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