RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PDPK1O15530 556 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RLBP1P12271 317 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TRIM32Q13049 653 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CLN3Q13286 438 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 HIF1AQ16665 826 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 DDR2Q16832 855 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TKFCQ3LXA3 575 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 C8orf48Q96LL4 319 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CEP89Q96ST8 783 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CHRDQ9H2X0 955 aa6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TXLNAP40222 546 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RHBDL3P58872 404 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CENPCQ03188 943 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 C2orf27AQ580R0 203 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 IER5Q5VY09 327 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PGBD3Q8N328 593 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 MPNDQ8N594 471 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ZNF516Q92618 1163 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ELP3Q9H9T3 547 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 IL21Q9HBE4 155 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 UBP1Q9NZI7 540 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 IDH3AP50213 366 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 GRIN2CQ14957 1233 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 JMYQ8N9B5 988 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PHC3Q8NDX5 983 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RELTQ969Z4 430 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 EID1Q9Y6B2 187 aa6.54□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 EREGO14944 169 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ADH1AP07327 375 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 VEGFBP49765 207 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ARSDP51689 593 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 APOBRQ0VD83 1088 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 SV2BQ7L1I2 683 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 NKD1Q969G9 470 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ST7Q9NRC1 585 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 USP20Q9Y2K6 914 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.53□□□□□ -1.36
STRADB-210ENST00000498648 CREB3O43889 395 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ADH1CP00326 375 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PF4P02776 101 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CRKP46108 304 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 LIG3P49916 1009 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 EMP3P54852 163 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 NR5A1Q13285 461 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TCEA2Q15560 299 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 MAP3K11Q16584 847 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SUSD3Q96L08 255 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PPT2Q9UMR5 302 aa6.52□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 KCNQ2O43526 872 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 INPP5BP32019 993 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 GIPRP48546 466 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FCGRTP55899 365 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 LMNB2Q03252 620 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 BIRC2Q13490 618 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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