RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 MTHFSP49914 203 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU4F2Q12837 409 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNH5Q8NCM2 988 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 PNMA1Q8ND90 353 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOPCQ9HD26 462 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.28□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 MST1RQ04912 1400 aa7.27□□□□□ -1.24
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.27□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.27□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRINP3Q76B58 766 aa7.27□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 IL27Q8NEV9 243 aa7.27□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.27□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 AMPHP49418 695 aa7.26□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 POTEAQ6S8J7 498 aa7.25□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.25□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.24□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NBPF15Q8N660 670 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.23□□□□□ -1.25
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEUROD2Q15784 382 aa7.22□□□□□ -1.25
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.21□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.2□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 IP6K1Q92551 441 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 RUNDC1Q96C34 613 aa7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.2□□□□□ -1.26
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