RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	MCC	P23508	829 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ANAPC15	P60006	121 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	BECN1	Q14457	450 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	NFIX	Q14938	502 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	IL17RA	Q96F46	866 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF609	O15014	1411 aa		11.4	□□□□□ -0.58
LPIN3-204	ENST00000496565	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC5A1	P13866	664 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	FGFR2	P21802	821 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNQ4	P56696	695 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	RILPL2	Q969X0	211 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.39	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SEMA3E	O15041	775 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	NPHP1	O15259	732 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	BBOX1	O75936	387 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SERPINB2	P05120	415 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.38	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SGSM2	O43147	1006 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PHF14	O94880	888 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SEC24B	O95487	1268 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PDE6B	P35913	854 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	TIMM10	P62072	90 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	GRAP	Q13588	217 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SNX21	Q969T3	373 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.36	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	RABEP1	Q15276	862 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59	2e-7	■■■□□ 17.8
LPIN3-204	ENST00000496565	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.35	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	MCM2	P49736	904 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	CHRND	Q07001	517 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.34	□□□□□ -0.59
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF827	Q17R98	1081 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	NPR1	P16066	1061 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LPIN3-204	ENST00000496565	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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