RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	MTR	Q99707	1265 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	USP16	Q9Y5T5	823 aa		7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC45	O75419	566 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAI2	P04899	355 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PDIA6	Q15084	440 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF827	Q17R98	1081 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ARX	Q96QS3	562 aa		7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	GNPAT	O15228	680 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ST8SIA5	O15466	376 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF14	O94880	888 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	STARD3NL	O95772	234 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	A1BG	P04217	495 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE1A	P54750	535 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	BECN1	Q14457	450 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SSH3	Q8TE77	659 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SNX21	Q969T3	373 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	AK7	Q96M32	723 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SBF2	Q86WG5	1849 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	MRC1	P22897	1456 aa		7.17	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	GNAI3	P08754	354 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXB7	P09629	217 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP4C	P60510	307 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF516	Q92618	1163 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	KAZALD1	Q96I82	304 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	IL25	Q9H293	177 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	NHS	Q6T4R5	1651 aa		7.16	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	RPS6KA4	O75676	772 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	GGCX	P38435	758 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	STAP2	Q9UGK3	403 aa		7.15	□□□□□ -1.26
C4BPB-208	ENST00000492730	BTAF1	O14981	1849 aa		7.15	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	AK9	Q5TCS8	1911 aa		7.15	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM187A	A6NFU0	413 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	HMMR	O75330	724 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	ITGB4	P16144	1822 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	RFC4	P35249	363 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		7.14	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF26	B4DH59	902 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	IGKV5-2	P06315	115 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	MYL6B	P14649	208 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC19A1	P41440	591 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	KSR2	Q6VAB6	950 aa		7.13	□□□□□ -1.27
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27

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