RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	IP6K1	Q92551	441 aa		7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RILPL2	Q969X0	211 aa		7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	KIF2C	Q99661	725 aa		7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ATP9B	O43861	1147 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FBLN1	P23142	703 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	MCM5	P33992	734 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	NEK4	P51957	841 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	EMP3	P54852	163 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PSME1	Q06323	249 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	LRRC37A3	O60309	1634 aa		7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZBBX	A8MT70	800 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ESPN	B1AK53	854 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RNF20	Q5VTR2	975 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	TICAM2	Q86XR7	235 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SSH3	Q8TE77	659 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	IL17RA	Q96F46	866 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.75	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PSMA5	P28066	241 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF592	Q92610	1267 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	OTUD5	Q96G74	571 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PEAK1	Q9H792	1746 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RAD50	Q92878	1312 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PIK3C2A	O00443	1686 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	BTBD11	A6QL63	1104 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	TPM2	P07951	284 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PDC	P20941	246 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CHML	P26374	656 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SSFA2	P28290	1259 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	TERF1	P54274	439 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CUL4A	Q13619	759 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	BRICD5	Q6PL45	260 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		7.73	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SRGAP3	O43295	1099 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	TPM3	P06753	285 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	HSPA4	P34932	840 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PPP4C	P60510	307 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	MTX1	Q13505	466 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	PTPRN	Q16849	979 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	EVI5L	Q96CN4	794 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
LRP2-204	ENST00000491228	FAM205C	A6NFA0	338 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228		F6X3S4	739 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	NR1I2	O75469	434 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	JUND	P17535	347 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	KCNA6	P17658	529 aa		7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	7.71	□□□□□ -1.18
LRP2-204	ENST00000491228	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18

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