RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483903.1

MTIF3-208, Transcript of mitochondrial translational initiation factor 3, human

TSL 2

Gene MTIF3, Length 403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTIF3-208	ENST00000483903	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	EGFR	P00533	1210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	GHRH	P01286	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	ATP11A	P98196	1134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	PTK7	Q13308	1070 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	GSC2	O15499	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	PSAP	P07602	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTIF3-208	ENST00000483903	RAD21	O60216	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ADAM11	O75078	769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	WEE1	P30291	646 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	WNT11	O96014	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	MYO19	Q96H55	970 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ARX	Q96QS3	562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L10	C9JJH3	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L12	C9JPN9	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L21	D6R901	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SOX18	P35713	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	GRIK1	P39086	918 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	JAG1	P78504	1218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	COX20	Q5RI15	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	GLMN	Q92990	594 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	EPHA1	P21709	976 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	CEP41	Q9BYV8	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FSCN2	O14926	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FOXO3	O43524	673 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	BMP3	P12645	472 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	CDC27	P30260	824 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	PREP	P48147	710 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	UVSSA	Q2YD98	709 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MTIF3-208	ENST00000483903	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms