RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 GPRC5DQ9NZD1 345 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 COL4A1P02462 1669 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 SHTN1A0MZ66 631 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 H7C1D1 291 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 ECE2O60344 883 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC27Q2M243 656 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 VPS33BQ9H267 617 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 POLLQ9UGP5 575 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 GGA1Q9UJY5 639 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 PASKQ96RG2 1323 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 YDJCA8MPS7 323 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD14O00487 310 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 IGKV5-2P06315 115 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 VEGFBP49765 207 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 MICALL2Q8IY33 904 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 AIDAQ96BJ3 306 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 KCNQ5Q9NR82 932 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CACNA1FO60840 1977 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CNTNAP1P78357 1384 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CTSWP56202 376 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 FLIIQ13045 1269 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 IL16Q14005 1332 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 F6X3S4 739 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CELF2O95319 508 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 WDR63Q8IWG1 891 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 TRPM4Q8TD43 1214 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 GREM2Q9H772 168 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ4P48050 445 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 FAM161AQ3B820 660 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 USP48Q86UV5 1035 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 XDHP47989 1333 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-209ENST00000480420 SCN9AQ15858 1988 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 PLIN1O60240 522 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 VAMP4O75379 141 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 GCKRQ14397 625 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 CYP4F22Q6NT55 531 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 DLK2Q6UY11 383 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 H7C1W4 665 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA6P23229 1130 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ATP2B4P23634 1241 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 CDC37L1Q7L3B6 337 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 KRT26Q7Z3Y9 468 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 LINS1Q8NG48 757 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 CAPNS2Q96L46 248 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 RASSF10A6NK89 507 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 AOC2O75106 756 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 EGFRP00533 1210 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ECE1P42892 770 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 LBX1P52954 281 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 CST9Q5W186 159 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 DPF2Q92785 391 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD8Q96I13 439 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 RTL9Q8NET4 1388 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L3A6NCW0 530 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L4A6NCW7 530 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 ADM5C9JUS6 153 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 TAF5LO75529 589 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-209ENST00000480420 RPS12P25398 132 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
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