RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475960.1

RBM34-206, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 477 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-206	ENST00000475960	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM34-206	ENST00000475960	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	TNS4	Q8IZW8	715 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	AKAP12	Q02952	1782 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ADCY9	O60503	1353 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	GC	P02774	474 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	SCTR	P47872	440 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ATP1A2	P50993	1020 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ACE	P12821	1306 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	EXOC5	O00471	708 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	LILRA1	O75019	489 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	CDCA8	Q53HL2	280 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	FAM196B	A6NMK8	535 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ATG7	O95352	703 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	RASA1	P20936	1047 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	GTF2I	P78347	998 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RBM34-206	ENST00000475960	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	OGFOD1	Q8N543	542 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	HPS1	Q92902	700 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ITPKC	Q96DU7	683 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	TIMP2	P16035	220 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CLDN10	P78369	228 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L15	C9J2P7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L10	C9JJH3	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L12	C9JPN9	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L11	C9JVI0	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L21	D6R901	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L18	D6R9N7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L22	D6RA61	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	TOMM70	O94826	608 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	USP6	P35125	1406 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	PTK7	Q13308	1070 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ABCC6	O95255	1503 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	GFRA3	O60609	400 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960		Q6ZVU0	165 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	SLIT3	O75094	1523 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	SIX5	Q8N196	739 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	AVP	P01185	164 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ADH1A	P07327	375 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	CBLB	Q13191	982 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
RBM34-206	ENST00000475960	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.96	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms