RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF609	O15014	1411 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	PDE8B	O95263	885 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140		A0A1B0GUL7	405 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	TIMM10	P62072	90 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	SDS	P20132	328 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MTA1-209	ENST00000469140	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	GRAP	Q13588	217 aa		28.81	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	PDE6B	P35913	854 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	ATP5J	P18859	108 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	CHRND	Q07001	517 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	COL4A1	P02462	1669 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	LPIN2	Q92539	896 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	CDC45	O75419	566 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	FGFR2	P21802	821 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	SPEF2	Q9C093	1822 aa		28.76	■■■□□ 2.2
MTA1-209	ENST00000469140	GORAB	Q5T7V8	394 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	TAF1	P21675	1872 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	TAF5L	O75529	589 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	SLC5A1	P13866	664 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	BBOX1	O75936	387 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	RILPL2	Q969X0	211 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	SRGN	P10124	158 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	NPR1	P16066	1061 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	ADORA1	P30542	326 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	CASC1	Q6TDU7	716 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	TMC4	Q7Z404	712 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	EVI5L	Q96CN4	794 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	HAUS7	Q99871	368 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MTA1-209	ENST00000469140	ALDH1B1	P30837	517 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	MASTL	Q96GX5	879 aa		28.7	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	MTFR1L	Q9H019	292 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140		H0YIN7	160 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	SNAP23	O00161	211 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	SEC24B	O95487	1268 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	ZBTB7A	O95365	584 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	KCNJ4	P48050	445 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	STYK1	Q6J9G0	422 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	CHML	P26374	656 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	XDH	P47989	1333 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MTA1-209	ENST00000469140	POLD1	P28340	1107 aa		28.64	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	SP8	Q8IXZ3	490 aa		28.64	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.64	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	PHKA1	P46020	1223 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	TICAM2	Q86XR7	235 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17	7e-10	■□□□□ 8.5
MTA1-209	ENST00000469140	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	HIP1	O00291	1037 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MTA1-209	ENST00000469140	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.61	■■■□□ 2.17

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