RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 PLA2G12BQ9BX93 195 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 TMEM88BA6NKF7 163 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 UFL1O94874 794 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 DBNDD1Q9H9R9 158 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 XDHP47989 1333 aa19.67■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 G3V3G9 751 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 DCAF8Q5TAQ9 597 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 GREM2Q9H772 168 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 E9PSI1 815 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 ECE2O60344 883 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 ATP2B4P23634 1241 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 CASP7P55210 303 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 DPF2Q92785 391 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 MYH3P11055 1940 aa19.64■□□□□ 0.74
NISCH-205ENST00000467594 F6X3S4 739 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 H7C1D1 291 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 CCER2I3L3R5 266 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 RPS12P25398 132 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 DOK7Q18PE1 504 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 BEND3Q5T5X7 828 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 PSMD14O00487 310 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 CSF1RP07333 972 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ITGA6P23229 1130 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 MICALL2Q8IY33 904 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 PGAP2Q9UHJ9 254 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 CNTNAP1P78357 1384 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ALDH1L1O75891 902 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 GRM8O00222 908 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 VIL1P09327 827 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 SLFN5Q08AF3 891 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 FAM161AQ3B820 660 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 PODNQ7Z5L7 613 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD2Q9GZV1 360 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 LEMD3Q9Y2U8 911 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 MED23Q9ULK4 1368 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-205ENST00000467594 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 FOXO4P98177 505 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 TRPM4Q8TD43 1214 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 PTPRCP08575 1304 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 RASSF10A6NK89 507 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 DEFB115Q30KQ5 88 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CDC37L1Q7L3B6 337 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 ZNF609O15014 1411 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SHTN1A0MZ66 631 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 TRAF5O00463 557 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SAMD7Q7Z3H4 446 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SPEF2Q9C093 1822 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 ZNF804BA4D1E1 1349 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 USP17L3A6NCW0 530 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 USP17L4A6NCW7 530 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 LMBR1LQ6UX01 489 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 USP17L1Q7RTZ2 530 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 COA1Q9GZY4 146 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 KCNJ4P48050 445 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 VEGFBP49765 207 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CHRNDQ07001 517 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CST9Q5W186 159 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SCN9AQ15858 1988 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-205ENST00000467594 TRPM7Q96QT4 1865 aa19.52■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 CELF2O95319 508 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 EPHA10Q5JZY3 1008 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-205ENST00000467594 GMLQ99445 158 aa19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms