RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 UFL1O94874 794 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 KCNJ4P48050 445 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 GPC2Q8N158 579 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 SNED1Q8TER0 1413 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 SBF1O95248 1867 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-209ENST00000462357 TNIP1Q15025 636 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 RRAGCQ9HB90 399 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.76■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 POLLQ9UGP5 575 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 RIMBP2O15034 1052 aa25.73■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.72■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.72■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 MYH3P11055 1940 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 TOMM70O94826 608 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 CHRNDQ07001 517 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 KAZALD1Q96I82 304 aa25.71■■□□□ 1.71
IMP4-209ENST00000462357 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.69■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.69■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 GNAI2P04899 355 aa25.69■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 KIF3CO14782 793 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 PODNQ7Z5L7 613 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 HACL1Q9UJ83 578 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 FBXO3Q9UK99 471 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.67■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.67■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 MEIS3Q99687 375 aa25.67■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ECE2O60344 883 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 CXCL9Q07325 125 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 SLC51AQ86UW1 340 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 COA1Q9GZY4 146 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.66■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 PLIN1O60240 522 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 C1QTNF8P60827 252 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 DOK7Q18PE1 504 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 TAF1P21675 1872 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 MED23Q9ULK4 1368 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 LRRC37AA6NMS7 1700 aa25.65■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 RAD17O75943 681 aa25.64■■□□□ 1.7
IMP4-209ENST00000462357 UBE4AQ14139 1066 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 METTL24Q5JXM2 366 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 FSTL1Q12841 308 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 TAF5LO75529 589 aa25.61■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.61■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 H7C1D1 291 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 EYA2O00167 538 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 SRGAP3O43295 1099 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 EPHX2P34913 555 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 DPF2Q92785 391 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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IMP4-209ENST00000462357 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.59■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 TNNQ9UQP3 1299 aa25.59■■□□□ 1.69
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IMP4-209ENST00000462357 USP17L4A6NCW7 530 aa25.58■■□□□ 1.69
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IMP4-209ENST00000462357 POTECB2RU33 542 aa25.58■■□□□ 1.69
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IMP4-209ENST00000462357 PDE3AQ14432 1141 aa25.58■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.58■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.58■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 VPS37DQ86XT2 251 aa25.58■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
IMP4-209ENST00000462357 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.58■■□□□ 1.69
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IMP4-209ENST00000462357 PSMD14O00487 310 aa25.57■■□□□ 1.68
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
IMP4-209ENST00000462357 PDE8BO95263 885 aa25.57■■□□□ 1.68
IMP4-209ENST00000462357 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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