RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436041.5

PRAMEF27-201, Transcript of PRAME family member 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF27, Length 1,863 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27-201ENST00000436041 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 HSCBQ8IWL3 235 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 BCORQ6W2J9 1755 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 ERFEQ4G0M1 354 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 CASC1Q6TDU7 716 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 OFD1O75665 1012 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 RILPL2Q969X0 211 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 AKT1S1Q96B36 256 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 RTL9Q8NET4 1388 aa14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF27-201ENST00000436041 GYS1P13807 737 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 SCN7AQ01118 1682 aa14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 TIMM10P62072 90 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 NFIXQ14938 502 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CNTROBQ8N137 903 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 NLRP3Q96P20 1036 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ATP5JP18859 108 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 TM4SF1P30408 202 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 METTL24Q5JXM2 366 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 EVI5LQ96CN4 794 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 A0A1B0GUL7 405 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 NPHP1O15259 732 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MCM5P33992 734 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ZNF827Q17R98 1081 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 MYH3P11055 1940 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 PDE8BO95263 885 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CHMLP26374 656 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 C4AP0C0L4 1744 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 SERPINB2P05120 415 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 REC8O95072 547 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ATP2B3Q16720 1220 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 CNBD1Q8NA66 436 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 XAGE2Q96GT9 111 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF27-201ENST00000436041 ABCC12Q96J65 1359 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 ZNF445P59923 1031 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 GORABQ5T7V8 394 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 HAUS7Q99871 368 aa14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 HIP1O00291 1037 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 ZNF609O15014 1411 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 BAG6P46379 1132 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 ST5P78524 1137 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF27-201ENST00000436041 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms