RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SLC27A2O14975 620 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 CUL4AQ13619 759 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2B3Q16720 1220 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 NUCB2P80303 420 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 SCARF1Q14162 830 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 RUFY3Q7L099 469 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 PARP10Q53GL7 1025 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.84■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 EP400Q96L91 3159 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 PI16Q6UXB8 463 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 TRAK2O60296 914 aa27.83■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.83■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 PDRG1Q9NUG6 133 aa27.83■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 NTSR2O95665 410 aa27.82■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC9Q9Y397 364 aa27.82■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 AFF2P51816 1311 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 RNF20Q5VTR2 975 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.81■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 AK7Q96M32 723 aa27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 BTAF1O14981 1849 aa27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.8■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 PDE8BO95263 885 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 VPS53Q5VIR6 699 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 TCEANC2Q96MN5 208 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 LARGE1O95461 756 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZAP70P43403 619 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.79■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.78■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.78■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.77■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 SNAP23O00161 211 aa27.76■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 IL27Q8NEV9 243 aa27.76■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.76■■■□□ 2.04
FAAP20-209ENST00000428120 MCAMP43121 646 aa27.76■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.76■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 MAST3O60307 1309 aa27.76■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 DTNBO60941 627 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 PSMA5P28066 241 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 BCORQ6W2J9 1755 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.75■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 SPEF2Q9C093 1822 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 M0R2C6 588 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 GNPATO15228 680 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 ERFEQ4G0M1 354 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 MCTP1Q6DN14 999 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 LRP5O75197 1615 aa27.74■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CYP21A2P08686 494 aa27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 OSBP2Q969R2 916 aa27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 PHKA1P46020 1223 aa27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 NHSQ6T4R5 1651 aa27.73■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 WASHC4Q2M389 1173 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC102BQ68D86 513 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.72■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.71■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KB1P23443 525 aa27.71■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 TSGA10IPQ3SY00 556 aa27.71■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.71■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 LPIN2Q92539 896 aa27.7■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.7■■■□□ 2.03
FAAP20-209ENST00000428120 ABCC12Q96J65 1359 aa27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.4 ms