RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC4A3P48751 1232 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AACSQ86V21 672 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa12.03□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ST5P78524 1137 aa12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NFIXQ14938 502 aa12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNBD1Q8NA66 436 aa12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBXO3Q9UK99 471 aa12.02□□□□□ -0.48
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POTEMA6NI47 508 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSF1RP07333 972 aa12.01□□□□□ -0.49
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TFCP2Q12800 502 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC10A5Q5PT55 438 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RILPL2Q969X0 211 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NLRP3Q96P20 1036 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTL9Q8NET4 1388 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TM4SF1P30408 202 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERFEQ4G0M1 354 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATG9AQ7Z3C6 839 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTLL11Q8NHH1 800 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIC1Q4ADV7 1423 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SERPINB2P05120 415 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHMLP26374 656 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRRC24Q50LG9 513 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC39A7Q92504 469 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARP3Q9Y6F1 533 aa12□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CIAO1O76071 339 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ITGA6P23229 1130 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TNNI3KQ59H18 835 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa11.99□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EYA2O00167 538 aa11.98□□□□□ -0.49
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASC1Q6TDU7 716 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF2CQ99661 725 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP26Q9BXU7 913 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METRNQ9UJH8 293 aa11.98□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERC2O15083 957 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPATCH3Q96I76 525 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GREM2Q9H772 168 aa11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MMP10P09238 476 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C7P10643 843 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 POTEGQ6S5H5 508 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTROBQ8N137 903 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL25Q9H293 177 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ABCC12Q96J65 1359 aa11.96□□□□□ -0.49
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASZ1Q86V15 1759 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDR1Q08345 913 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPR108Q9NPR9 543 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.96□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE6BP35913 854 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF609O15014 1411 aa11.95□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LRP5O75197 1615 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIMM10P62072 90 aa11.94□□□□□ -0.5
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BECN1Q14457 450 aa11.94□□□□□ -0.5
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