RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 GHRHP01286 108 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 PDGFAP04085 211 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ACPPP15309 386 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 SELPP16109 830 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 SERPINB4P48594 390 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 AAMPQ13685 434 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 PCSK7Q16549 785 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 C8orf34Q49A92 452 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 MSL1Q68DK7 614 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 OR13H1Q8NG92 308 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ELP3Q9H9T3 547 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 FAM13BQ9NYF5 915 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 CNTN3Q9P232 1028 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 POLIQ9UNA4 740 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 TRPA1O75762 1119 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 CDC25BP30305 580 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 SOX18P35713 384 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 GATA4P43694 442 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 RAC1P63000 192 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 PDE4CQ08493 712 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 FZD6O60353 706 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ELNP15502 786 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 HYAL2Q12891 473 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 CEP135Q66GS9 1140 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 ILDR2Q71H61 639 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 USTQ9Y2C2 406 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRC-208ENST00000427110 H3BRB1 525 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ADAM23O75077 832 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 MBTPS1Q14703 1052 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 NCAPG2Q86XI2 1143 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 HHIPQ96QV1 700 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 RBSNQ9H1K0 784 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 USP21Q9UK80 565 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 EREGO14944 169 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 PCSK2P16519 638 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 CES1P23141 567 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 FBXO11Q86XK2 927 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TTC9Q92623 222 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SPACA7Q96KW9 195 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 CHRDQ9H2X0 955 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 LINC01387J3KSC0 135 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ICMTO60725 284 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 FAM13AO94988 1023 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ALX3O95076 343 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 KIF4AO95239 1232 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 NPR3P17342 541 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ITGB7P26010 798 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 IREB2P48200 963 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ADGRE1Q14246 886 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SETDB1Q15047 1291 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 CEP120Q8N960 986 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TTC16Q8NEE8 873 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 NACC1Q96RE7 527 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 PBX4Q9BYU1 374 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 MTMR7Q9Y216 660 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 C9orf172C9J069 976 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 PHACTR2O75167 634 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TNFRSF21O75509 655 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 EPHA1P21709 976 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ECM1Q16610 540 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRC-208ENST00000427110 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.43□□□□□ -1.7
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