RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHLPP1O60346 1717 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCHHQ07283 1943 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.34■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.33■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.33■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NECAB1Q8N987 351 aa22.33■■□□□ 1.17
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS2O95450 1211 aa22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.32■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F13A1P00488 732 aa22.31■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP21A2P08686 494 aa22.31■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.31■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.31■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADORA1P30542 326 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XAGE2Q96GT9 111 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEK1Q96PY6 1258 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSWP56202 376 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDB1Q16531 1140 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP48Q86UV5 1035 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GREM2Q9H772 168 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTNBO60941 627 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGA6P23229 1130 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GORABQ5T7V8 394 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTMR6Q9Y217 621 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.29■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.28■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMA4Q16363 1823 aa22.28■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAST3O60307 1309 aa22.28■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.27■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL24Q5JXM2 366 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.26■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLIT2O94813 1529 aa22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP2B3Q16720 1220 aa22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC12Q96J65 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.25■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYCE3A1L190 88 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE8AO60658 829 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCARF1Q14162 830 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0R2C6 588 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RREB1Q92766 1687 aa22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JS52 829 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZUG5 572 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRP5O75197 1615 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH7P12883 1935 aa22.23■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDCP20941 246 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK3Q13188 491 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSBP2Q969R2 916 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1AP38606 617 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZAP70P43403 619 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms