RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-206	ENST00000414253	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	NECAB1	Q8N987	351 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	KIF3A	Q9Y496	699 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	MED23	Q9ULK4	1368 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	ELP1	O95163	1332 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	KCNJ4	P48050	445 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	TTC6	Q86TZ1	520 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	TSC1	Q92574	1164 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	PSMA5	P28066	241 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	PDC	P20941	246 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	SLC27A2	O14975	620 aa		29.01	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		29.01	■■■□□ 2.24
FAAP20-206	ENST00000414253	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	SPC24	Q8NBT2	197 aa		29	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		29	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	JCAD	Q9P266	1359 aa		29	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	HAUS7	Q99871	368 aa		29	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	PIGB	Q92521	554 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	LIG1	P18858	919 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	TYRO3	Q06418	890 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ANKRD1	Q15327	319 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	RNF20	Q5VTR2	975 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	TAF5L	O75529	589 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	TCIRG1	Q13488	830 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	ITGB4	P16144	1822 aa		28.95	■■■□□ 2.23
FAAP20-206	ENST00000414253	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CAMK4	Q16566	473 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	EYA2	O00167	538 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TNMD	Q9H2S6	317 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	RPS6KB1	P23443	525 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	ZNF609	O15014	1411 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TIMM10	P62072	90 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	LUZP1	Q86V48	1076 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	DACT1	Q9NYF0	836 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CHGB	P05060	677 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	FAM177B	A6PVY3	158 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	PTGS1	P23219	599 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	SPATA32	Q96LK8	384 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CIAO1	O76071	339 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CBX8	Q9HC52	389 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	STARD3NL	O95772	234 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
FAAP20-206	ENST00000414253	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		28.89	■■■□□ 2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms