RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412722.1

LINC00427-201, long intergenic non-protein coding RNA 427, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00427, Length 430 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00427-201ENST00000412722 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 VEGFBP49765 207 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 GRM2Q14416 872 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 A0A1W2PNR3 127 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 GDF9O60383 454 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 RLBP1P12271 317 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 EDN3P14138 238 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CES1P23141 567 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 RELL1Q8IUW5 271 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 RNF217Q8TC41 542 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 NBPF4Q96M43 638 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CEP63Q96MT8 703 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SPON2Q9BUD6 331 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 COPRSQ9NQ92 184 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CNTN3Q9P232 1028 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 NFE2L2Q16236 605 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SDE2Q6IQ49 451 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 EHD4Q9H223 541 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 PIF1Q9H611 641 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TBX22Q9Y458 520 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 NLRP8Q86W28 1048 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 A0A1W2PP55 124 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 BMP2P12643 396 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 KCNQ4P56696 695 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 HPS1Q92902 700 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM74Q96NL1 305 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 BRD7Q9NPI1 651 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00427-201ENST00000412722 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PRR20EP86478 221 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PRR20CP86479 221 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PRR20DP86480 221 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PRR20BP86481 221 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PRR20AP86496 221 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 SV2BQ7L1I2 683 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PGBD3Q8N328 593 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 MKL1Q969V6 931 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 SYNJ1O43426 1573 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 TNFRSF10AO00220 468 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 HSPA2P54652 639 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 FCGRTP55899 365 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 OR13H1Q8NG92 308 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 TOP2BQ02880 1626 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 TTLL8A6PVC2 850 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 F11P03951 625 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 RHOQP17081 205 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 NASPP49321 788 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 MAP3K10Q02779 954 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 SERINC3Q13530 473 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 CCINQ13939 588 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00427-201ENST00000412722 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.5□□□□□ -1.37
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