RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 GGA1Q9UJY5 639 aa35.43■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF521Q96K83 1311 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 UFL1O94874 794 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 PLA2G12BQ9BX93 195 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 CNTNAP1P78357 1384 aa35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 XDHP47989 1333 aa35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 ECE2O60344 883 aa35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 DPF2Q92785 391 aa35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 PCNTO95613 3336 aa35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 GREM2Q9H772 168 aa35.39■■■■□ 3.26
ANKRD54-203ENST00000407117 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 MYH3P11055 1940 aa35.38■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMD14O00487 310 aa35.37■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 DOK7Q18PE1 504 aa35.37■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 H7C1D1 291 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 RPS12P25398 132 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 CASP7P55210 303 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP2B4P23634 1241 aa35.35■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 PGAP2Q9UHJ9 254 aa35.35■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 G3V3G9 751 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 DCAF8Q5TAQ9 597 aa35.34■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 MICALL2Q8IY33 904 aa35.33■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
ANKRD54-203ENST00000407117 BEND3Q5T5X7 828 aa35.32■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 MINPP1Q9UNW1 487 aa35.32■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 RASSF10A6NK89 507 aa35.31■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 F6X3S4 739 aa35.31■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 CSF1RP07333 972 aa35.31■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPM4Q8TD43 1214 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNQ5Q9NR82 932 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 VIL1P09327 827 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ITGA6P23229 1130 aa35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 IFFO2Q5TF58 517 aa35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 SHTN1A0MZ66 631 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 E9PSI1 815 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 DEFB115Q30KQ5 88 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM161AQ3B820 660 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 MED23Q9ULK4 1368 aa35.26■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAF5O00463 557 aa35.26■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 VEGFBP49765 207 aa35.26■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 PODNQ7Z5L7 613 aa35.26■■■■□ 3.24
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF609O15014 1411 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.25■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CDC37L1Q7L3B6 337 aa35.24■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 LEMD3Q9Y2U8 911 aa35.24■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CST9Q5W186 159 aa35.23■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SAMD7Q7Z3H4 446 aa35.23■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD2Q9GZV1 360 aa35.23■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SCN9AQ15858 1988 aa35.23■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 GRM8O00222 908 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ALDH1L1O75891 902 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 AGBL3Q8NEM8 1001 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXO4P98177 505 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 SPEF2Q9C093 1822 aa35.2■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.2■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 CCER2I3L3R5 266 aa35.2■■■■□ 3.23
ANKRD54-203ENST00000407117 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 TLL2Q9Y6L7 1015 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 USP17L3A6NCW0 530 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 USP17L4A6NCW7 530 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 SLFN5Q08AF3 891 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC4A10Q6U841 1118 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 USP17L1Q7RTZ2 530 aa35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CELF2O95319 508 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 COA1Q9GZY4 146 aa35.17■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 PSME4Q14997 1843 aa35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF804BA4D1E1 1349 aa35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 EGFRP00533 1210 aa35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa35.16■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 ECE1P42892 770 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 GMLQ99445 158 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 PTPRCP08575 1304 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CHRNDQ07001 517 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 LMBR1LQ6UX01 489 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.14■■■■□ 3.22
ANKRD54-203ENST00000407117 USP17L8P0C7I0 530 aa35.12■■■■□ 3.21
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