RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 CHGBP05060 677 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.22■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 SPEF2Q9C093 1822 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 JAK2O60674 1132 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 SASS6Q6UVJ0 657 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 PIBF1Q8WXW3 757 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 DSCC1Q9BVC3 393 aa31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 ERVV-2B6SEH9 535 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.2■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HOXD13-201ENST00000392539 PAPPAQ13219 1627 aa31.2■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 MYH15Q9Y2K3 1946 aa31.2■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 BRF1Q92994 677 aa31.2■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 GOLIM4O00461 696 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 RESTQ13127 1097 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC191Q8NCU4 936 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 FAM200AQ8TCP9 573 aa31.19■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 KCPQ6ZWJ8 1503 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 FGD1P98174 961 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 TNMDQ9H2S6 317 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 UQCRHLA0A096LP55 91 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 H3BQV1 296 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 PFKFB2O60825 505 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 UQCRHP07919 91 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 PLCB2Q00722 1185 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 TYRO3Q06418 890 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 IFFO2Q5TF58 517 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 DACT1Q9NYF0 836 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 EYA2O00167 538 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 TPM3P06753 285 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 STOX1Q6ZVD7 989 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 MPNDQ8N594 471 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 ATG3Q9NT62 314 aa31.17■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 WDR17Q8IZU2 1322 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CIAO1O76071 339 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 TIMM10P62072 90 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 SCRN1Q12765 414 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 AP5Z1O43299 807 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CAMK4Q16566 473 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CLSTN2Q9H4D0 955 aa31.15■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP45Q9UL16 551 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 A1BGP04217 495 aa31.14■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
HOXD13-201ENST00000392539 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 DDX11Q96FC9 970 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC2Q9BYS8 371 aa31.13■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 KIF3AQ9Y496 699 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC24Q50LG9 513 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 PGBD1Q96JS3 809 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 AGXT2Q9BYV1 514 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 PDCL3Q9H2J4 239 aa31.12■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 DYNC1I1O14576 645 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 BICD2Q8TD16 824 aa31.11■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GUL7 405 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 CKAP2LQ8IYA6 745 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 PRDM11Q9NQV5 511 aa31.1■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 SPTLC3Q9NUV7 552 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 CHMP4CQ96CF2 233 aa31.09■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 MAST3O60307 1309 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 E7EWF7 191 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 SLFNL1Q499Z3 407 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 NR1I2O75469 434 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 APOBRQ0VD83 1088 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 ANO6Q4KMQ2 910 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 TNS2Q63HR2 1409 aa31.08■■■□□ 2.57
HOXD13-201ENST00000392539 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 PTPDC1A2A3K4 754 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 CBX8Q9HC52 389 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO3Q9UK99 471 aa31.06■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 CTDNEP1O95476 244 aa31.05■■■□□ 2.56
HOXD13-201ENST00000392539 ISCA1Q9BUE6 129 aa31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms