RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 LAMA4Q16363 1823 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 KRT32Q14532 448 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD7Q92527 254 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 A0A087WWV3 80 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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CITED2-201ENST00000367651 H3BQV1 296 aa22.16■■□□□ 1.14
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CITED2-201ENST00000367651 IFFO2Q5TF58 517 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 CTDNEP1O95476 244 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 IQCB1Q15051 598 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ARID5BQ14865 1188 aa22.14■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 USP16Q9Y5T5 823 aa22.14■■□□□ 1.14
CITED2-201ENST00000367651 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.14■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 HAUS7Q99871 368 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 APOBRQ0VD83 1088 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ERBB3P21860 1342 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 PFKFB2O60825 505 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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CITED2-201ENST00000367651 TNNT1P13805 278 aa22.11■■□□□ 1.13
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CITED2-201ENST00000367651 USP28Q96RU2 1077 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 CFAP45Q9UL16 551 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 USP27XA6NNY8 438 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 FGD1P98174 961 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.1■■□□□ 1.13
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CITED2-201ENST00000367651 DMTNQ08495 405 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 PHKG2P15735 406 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 GUCY1B3Q02153 619 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 MEGF6O75095 1541 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 A0A087WZG4 1122 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 SMTNL1A8MU46 457 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED2-201ENST00000367651 CDC25BP30305 580 aa22.08■■□□□ 1.13
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CITED2-201ENST00000367651 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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CITED2-201ENST00000367651 CHST3Q7LGC8 479 aa22.07■■□□□ 1.12
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CITED2-201ENST00000367651 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.07■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 STX1AQ16623 288 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED2-201ENST00000367651 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.05■■□□□ 1.12
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