RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 UBE4AQ14139 1066 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 A2MP01023 1474 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 RTL9Q8NET4 1388 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 GRM8O00222 908 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TRIM47Q96LD4 638 aa14.85□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 SH2D4AQ9H788 454 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 STX1AQ16623 288 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 DPH6Q7L8W6 267 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CNBD1Q8NA66 436 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 UBXN4Q92575 508 aa14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 KSR2Q6VAB6 950 aa14.83□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 TMX1Q9H3N1 280 aa14.83□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.83□□□□□ -0.03
NLRC3-202ENST00000359128 BIN1O00499 593 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 BMP15O95972 392 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 NOD1Q9Y239 953 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PLCH2O75038 1416 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ALDH1L1O75891 902 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 IL16Q14005 1332 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ALG1Q9BT22 464 aa14.83□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PTPN14Q15678 1187 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 FAM13AO94988 1023 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC102BQ68D86 513 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PPFIA3O75145 1194 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC184Q52MB2 194 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.82□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 MCM4P33991 863 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 FSD2A1L4K1 749 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ISM2Q6H9L7 571 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RGS22Q8NE09 1264 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ABCC1P33527 1531 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 FBLN1P23142 703 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 DCAF5Q96JK2 942 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 H0YIN7 160 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 UFL1O94874 794 aa14.81□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TTC22Q5TAA0 569 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 JAG2Q9Y219 1238 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TRPM2O94759 1503 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RFX1P22670 979 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 BACH1O14867 736 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SP4Q02446 784 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 AFMP43652 599 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TMC6Q7Z403 805 aa14.8□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PLVAPQ9BX97 442 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 UQCRHP07919 91 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 PPM1EQ8WY54 764 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 MAP3K5Q99683 1374 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SHTN1A0MZ66 631 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 KRT2P35908 639 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 DDX12PQ92771 950 aa14.79□□□□□ -0.04
NLRC3-202ENST00000359128 HOOK2Q96ED9 719 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms