RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CERS3Q8IU89 383 aa19.69■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 CAVIN2O95810 425 aa19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
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GDE1-201ENST00000353258 CABLES1Q8TDN4 633 aa19.68■□□□□ 0.74
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GDE1-201ENST00000353258 RAB11FIP3O75154 756 aa19.67■□□□□ 0.74
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GDE1-201ENST00000353258 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 KCND1Q9NSA2 647 aa19.65■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.65■□□□□ 0.74
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GDE1-201ENST00000353258 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.65■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.65■□□□□ 0.74
GDE1-201ENST00000353258 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa19.64■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.63■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 TPM4P67936 248 aa19.63■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ST5P78524 1137 aa19.63■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 GORABQ5T7V8 394 aa19.63■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.62■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 RSPH14Q9UHP6 348 aa19.62■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.62■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 NECTIN1Q15223 517 aa19.61■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 RASSF4Q9H2L5 321 aa19.61■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 UBXN4Q92575 508 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB9Q96C00 473 aa19.6■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 STK3Q13188 491 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ZNF790Q6PG37 636 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 SUCLG2Q96I99 432 aa19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
GDE1-201ENST00000353258 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 ALDH1L1O75891 902 aa19.59■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
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GDE1-201ENST00000353258 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 TATP17735 454 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN26Q16670 478 aa19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 C10orf67Q8IYJ2 551 aa19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 DDX11Q96FC9 970 aa19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 LCMT1Q9UIC8 334 aa19.58■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
GDE1-201ENST00000353258 KAZALD1Q96I82 304 aa19.57■□□□□ 0.72
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