RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.94■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 ARID5BQ14865 1188 aa28.94■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 SASH1O94885 1247 aa28.93■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTS2O95450 1211 aa28.92■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.92■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 DACT1Q9NYF0 836 aa28.92■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.92■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 GTF3C6Q969F1 213 aa28.92■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 IGKV5-2P06315 115 aa28.91■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 FAM227BQ96M60 508 aa28.91■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 ALDH1L1O75891 902 aa28.91■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 HYPKQ9NX55 129 aa28.9■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 MTX1Q13505 466 aa28.9■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF165P49910 485 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJC25Q9H1X3 360 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 LINS1Q8NG48 757 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.89■■■□□ 2.22
PKDCC-201ENST00000294964 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
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PKDCC-201ENST00000294964 CDC25BP30305 580 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 KRT85P78386 507 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 FAM173BQ6P4H8 233 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 COPS6Q7L5N1 327 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 BTG4Q9NY30 223 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 MYD88Q99836 296 aa28.88■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.88■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa28.87■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.87■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 LRP6O75581 1613 aa28.87■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 ELP1O95163 1332 aa28.86■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.85■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 STRN4Q9NRL3 753 aa28.85■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 RNF20Q5VTR2 975 aa28.84■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 NRAPQ86VF7 1730 aa28.84■■■□□ 2.21
PKDCC-201ENST00000294964 CLSTN2Q9H4D0 955 aa28.84■■■□□ 2.21
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PKDCC-201ENST00000294964 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.82■■■□□ 2.2
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PKDCC-201ENST00000294964 PLA2G4AP47712 749 aa28.82■■■□□ 2.2
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PKDCC-201ENST00000294964 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 NECAB1Q8N987 351 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 CCZ1BP86790 482 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 GPATCH3Q96I76 525 aa28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.81■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PKDCC-201ENST00000294964 PHKG2P15735 406 aa28.81■■■□□ 2.2
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