RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.93■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 NBPF6Q5VWK0 638 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 NBPF4Q96M43 638 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 ATP7BP35670 1465 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 RPS6KB1P23443 525 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 MAP3K12Q12852 859 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 TXLNBQ8N3L3 684 aa18.92■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 PTCH1Q13635 1447 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 CHD1O14646 1710 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 ERLIN2O94905 339 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 PTPDC1A2A3K4 754 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 SUCLG2Q96I99 432 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.91■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 KIAA0754O94854 1291 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 KCNQ3O43525 872 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 LTKP29376 864 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 LAMC1P11047 1609 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 SSH2Q76I76 1423 aa18.9■□□□□ 0.62
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 KIF5CO60282 957 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 IQCEQ6IPM2 695 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CPLX3Q8WVH0 158 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 STAP2Q9UGK3 403 aa18.89■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 E9PCH4 1651 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 SYKP43405 635 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 PTH1RQ03431 593 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF790Q6PG37 636 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 GBP3Q9H0R5 595 aa18.88■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC102BQ68D86 513 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ME3Q16798 604 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ABCC3O15438 1527 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 TIMM10P62072 90 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 RASEFQ8IZ41 740 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ALG1Q9BT22 464 aa18.87■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ABCA6Q8N139 1617 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 PRC1O43663 620 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 USP5P45974 858 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ATP2B3Q16720 1220 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 FBXO3Q9UK99 471 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 TNNI3KQ59H18 835 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 IQCA1Q86XH1 822 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.86■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 SPTLC2O15270 562 aa18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 SLC5A1P13866 664 aa18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 BEND3Q5T5X7 828 aa18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 RGS12O14924 1447 aa18.85■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CUL4AQ13619 759 aa18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 TMX1Q9H3N1 280 aa18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 NEFHP12036 1026 aa18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 CASQ1P31415 396 aa18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
MEGF6-201ENST00000294599 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms