RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.69■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.69■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 TRAK2O60296 914 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 GORABQ5T7V8 394 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 VPS53Q5VIR6 699 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 PKP1Q13835 747 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.68■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.68■■□□□ 1.22
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GDPD1-201ENST00000284116 CPA1P15085 419 aa22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 PTMSP20962 102 aa22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 ATP2B3Q16720 1220 aa22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 RUFY3Q7L099 469 aa22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.67■■□□□ 1.22
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GDPD1-201ENST00000284116 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.67■■□□□ 1.22
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GDPD1-201ENST00000284116 BCORQ6W2J9 1755 aa22.66■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 PSMA5P28066 241 aa22.66■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.66■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
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GDPD1-201ENST00000284116 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.65■■□□□ 1.22
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GDPD1-201ENST00000284116 FAM177BA6PVY3 158 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 NTSR2O95665 410 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 BTAF1O14981 1849 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC12Q96J65 1359 aa22.64■■□□□ 1.22
GDPD1-201ENST00000284116 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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GDPD1-201ENST00000284116 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 LAMB2P55268 1798 aa22.63■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 LRP5O75197 1615 aa22.63■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 NHSQ6T4R5 1651 aa22.63■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.61■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 SCARF1Q14162 830 aa22.61■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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GDPD1-201ENST00000284116 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.61■■□□□ 1.21
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GDPD1-201ENST00000284116 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.61■■□□□ 1.21
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GDPD1-201ENST00000284116 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.61■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 RTL9Q8NET4 1388 aa22.6■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 BRD1O95696 1058 aa22.6■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 KRT32Q14532 448 aa22.6■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.6■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.6■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 ZAP70P43403 619 aa22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 RPS6KB1P23443 525 aa22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 MYH7P12883 1935 aa22.58■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 FGFR2P21802 821 aa22.58■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 HSPA1LP34931 641 aa22.58■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.58■■□□□ 1.21
GDPD1-201ENST00000284116 MAST3O60307 1309 aa22.57■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 RPS6KA4O75676 772 aa22.57■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 LARGE1O95461 756 aa22.57■■□□□ 1.2
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GDPD1-201ENST00000284116 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.57■■□□□ 1.2
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GDPD1-201ENST00000284116 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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GDPD1-201ENST00000284116 FAM182BQ5T319 152 aa22.57■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 MCTP1Q6DN14 999 aa22.57■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 SBF2Q86WG5 1849 aa22.56■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 OSBP2Q969R2 916 aa22.56■■□□□ 1.2
GDPD1-201ENST00000284116 M0R2C6 588 aa22.55■■□□□ 1.2
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