RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274605.5

N4BP3-201, Transcript of NEDD4 binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene N4BP3, Length 6,080 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3-201ENST00000274605 CEP135Q66GS9 1140 aa20.52■□□□□ 0.88
N4BP3-201ENST00000274605 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.52■□□□□ 0.88
N4BP3-201ENST00000274605 POLKQ9UBT6 870 aa20.52■□□□□ 0.88
N4BP3-201ENST00000274605 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.52■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.52■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MYZAPP0CAP1 466 aa20.51■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 SIRT1Q96EB6 747 aa20.51■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RMND1Q9NWS8 449 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 UVSSAQ2YD98 709 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 C8orf37Q96NL8 207 aa20.5■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 NAPAP54920 295 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC174Q6PII3 467 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 TMTC2Q8N394 836 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 AKR1B10O60218 316 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 TFCP2Q12800 502 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 ERMNQ8TAM6 284 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.49■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 JAG2Q9Y219 1238 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CTR9Q6PD62 1173 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DACT1Q9NYF0 836 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DDB1Q16531 1140 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DHX58Q96C10 678 aa20.48■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 F13A1P00488 732 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 APOBRQ0VD83 1088 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 DRC1Q96MC2 740 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CEP85Q6P2H3 762 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CALM1P0DP23 149 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CALM2P0DP24 149 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 CALM3P0DP25 149 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RLBP1P12271 317 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RXRAP19793 462 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 ASIC1P78348 528 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.46■□□□□ 0.87
N4BP3-201ENST00000274605 POTEB2H3BUK9 544 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 PTGS1P23219 599 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 IL2RBP14784 551 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 SPAG5Q96R06 1193 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 AK2P54819 239 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 RGS22Q8NE09 1264 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 INCENPQ9NQS7 918 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 PTPRKQ15262 1439 aa20.45■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 TBC1D5Q92609 795 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 PSMD1Q99460 953 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 VAMP4O75379 141 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 RIMBP2O15034 1052 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 LINS1Q8NG48 757 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 CAVIN2O95810 425 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 VEZTQ9HBM0 779 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.44■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 BMP15O95972 392 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 SKILP12757 684 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 COMMD10Q9Y6G5 202 aa20.43■□□□□ 0.86
N4BP3-201ENST00000274605 RTL1A6NKG5 1358 aa20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms