RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261206.7

ACSS3-201, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACSS3, Length 2,666 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-201ENST00000261206 USP28Q96RU2 1077 aa22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 TAF5LO75529 589 aa22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 SCRN1Q12765 414 aa22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 PLA2G4AP47712 749 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.14■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
ACSS3-201ENST00000261206 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 JCADQ9P266 1359 aa22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 KCNQ3O43525 872 aa22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 FSIP1Q8NA03 581 aa22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.14■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SMC2O95347 1197 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ME1P48163 572 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 KRT32Q14532 448 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 GORABQ5T7V8 394 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 TMC6Q7Z403 805 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 HOXC9P31274 260 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 COL15A1P39059 1388 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.133e-8■■□□□ 12.7
ACSS3-201ENST00000261206 SIL1Q9H173 461 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 NWD1Q149M9 1564 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 IFNKQ9P0W0 207 aa22.12■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SLC20A2Q08357 652 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 PDE4CQ08493 712 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 HOMER1Q86YM7 354 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 LGR6Q9HBX8 967 aa22.11■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 PPFIA3O75145 1194 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SDF4Q9BRK5 362 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 HOXB7P09629 217 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 UBXN4Q92575 508 aa22.1■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ALDH1L1O75891 902 aa22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 KAZALD1Q96I82 304 aa22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 DNAI1Q9UI46 699 aa22.09■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 CHGBP05060 677 aa22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 CYP21A2P08686 494 aa22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 NLRP6P59044 892 aa22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 SUCLG2Q96I99 432 aa22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACSS3-201ENST00000261206 A0A1B0GVL5 298 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 CTDNEP1O95476 244 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 GUCY1B3Q02153 619 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 NEK11Q8NG66 645 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PTPRUQ92729 1446 aa22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 KCNJ6P48051 423 aa22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PROSER3Q2NL68 480 aa22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PFKFB2O60825 505 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 NRDCO43847 1150 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 TEX35Q5T0J7 233 aa22.06■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 PIK3C2AO00443 1686 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 FANCGO15287 622 aa22.05■■□□□ 1.12
ACSS3-201ENST00000261206 TUBB4AP04350 444 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms