RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.39■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF609O15014 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 SYT1P21579 422 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ITPK1Q13572 414 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 HAUS7Q99871 368 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.38■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 TCIRG1Q13488 830 aa22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 GJB2P29033 226 aa22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 STX6O43752 255 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 HLFQ16534 295 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 POTEAQ6S8J7 498 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.36■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 SYCE3A1L190 88 aa22.35■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 USP48Q86UV5 1035 aa22.35■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 EYA2O00167 538 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLIM4O00461 696 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF20Q5VTR2 975 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 PSMA5P28066 241 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNQ4P56696 695 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 RBSNQ9H1K0 784 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.34■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM89AQ96GI7 184 aa22.33■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PDLIM4-201ENST00000253754 MBD3O95983 291 aa22.33■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 RPS6KB1P23443 525 aa22.33■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.33■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.32■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 GPTP24298 496 aa22.32■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 SYNE4Q8N205 404 aa22.32■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A1B0GUL7 405 aa22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 F13A1P00488 732 aa22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.3■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 BTAF1O14981 1849 aa22.3■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.3■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 MTMR6Q9Y217 621 aa22.3■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 GPR108Q9NPR9 543 aa22.29■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.29■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 NUP98P52948 1817 aa22.29■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 CIAO1O76071 339 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 CYP21A2P08686 494 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 RXRBP28702 533 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 STK3Q13188 491 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.28■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 NHSQ6T4R5 1651 aa22.27■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 ADORA1P30542 326 aa22.27■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.27■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 FIBPO43427 364 aa22.27■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PDLIM4-201ENST00000253754 NLRP10Q86W26 655 aa22.27■■□□□ 1.16
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PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.26■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.26■■□□□ 1.15
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PDLIM4-201ENST00000253754 SBF2Q86WG5 1849 aa22.26■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 NEK1Q96PY6 1258 aa22.26■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A0G2JLW4 131 aa22.25■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD1Q15327 319 aa22.25■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 TCHHQ07283 1943 aa22.25■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.24■■□□□ 1.15
PDLIM4-201ENST00000253754 RREB1Q92766 1687 aa22.24■■□□□ 1.15
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